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Encontrando-se Aljezur integrado no Parque Natural da Costa Vicentina, a fauna e a flora desta região, é muito rica e variada, existindo mesmo algumas espécies únicas que só aqui se encontram.
Em Aljezur, predomina as seguintes espécies:
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Aves: Gaivota, Cegonha, Águia - Sapeira, Águia - Pesqueira, Peneireiro, Perdiz, Pisco, Melro, Carriça, Rouxinol, Cartaxo, Pato Bravo, Narceja, Codorniz, Turcas, Galinha d’água, Corvo, Gavião, Pardal, Picanço, Coruja, Mocho, Pintassilgo, Guarda-Rios, Rouxinol dos Caniços, Garça Branca, Garça Pequena, Trigueirão, Tentilhão, Abelharuco, Pica-Pau.
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Animais Terrestres: Lontra, Toupeira, Rato d’agua, Rã verde, Cágado de Carapaça estriada, Ouriço -Cacheiro, Lebre, Coelho, Javali, Techugo, Doninha, Saca - Rabos, Raposa, Furão, Gato-Bravo
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Animais do Mar: Sargo, Robalo, Sardinha, Moreia, Carapau, Faneca, Safio, Safia, Dourada, Bodião, Bezugo, Salema, Corvina, Peixe Porco, Anchova, Achegã, Liza, Bordalo, Abrótea, Badejo, Rascasso, Choupa, Ruivo, Caboz, Cavala, Salmonete, pargo, Bica, Raia, Linguado, Avaria, Enguia, Tainha, Polvo, Lula, Choco.
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Marisco: Perceves, Lagostim, Lagosta, Santola, Navalheira, Lavagante, Búzios, Amêijoa Preta, Berbigão, Lingueirão, Caramujos, Lapas, Mexilhão, Ouriços do Mar, Estrela-do-mar, Bugau
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